Studia podyplomowe adresowane są do wszystkich, którzy chcieliby podnieść lub zmienić swoje kwalifikacje. Wyższa Szkoła Bankowa w Toruniu posiada w swojej ofercie na rok akademicki 2010/2011 29 specjalności. Przygotowując programy nauczania uczelnia współpracuje ze znakomitymi fachowcami różnych branż, praktykami życia gospodarczego oraz wykładowcami akademickimi. Podstawowym walorem studiów podyplomowych w WSB jest duży nacisk na praktyczny aspekt zajęć.